Особое внимание в МАГУ уделяется разработке исследовательских, социальных, управленческих проектов. Работа над проектами позволяет отработать навыки изменения и управления окружающей реальностью, самоорганизации и организации работы команд, планирования времени и ресурсов для достижения поставленных целей.

В сотрудничестве с краевыми властями кураторами управленческих проектов являются руководители (заместители руководителей) региональных органов государственной власти, что способствует развитию проектных компетенций слушателей, присвоению ими передовых управленческих технологий, их вовлечению в реальные процессы, проходящие в регионе. Для слушателей МАГУ организован семинар по основам управленческого проектирования под руководством заместителя министра территориального развития Пермского края П.И.Блуся.

Ежегодно слушатели МАГУ проводят несколько полномасштабных исследований по актуальной тематике регионального управления, а также в сфере образования и молодежной политики. Большинство исследований проводятся по заказу региональных органов власти, на их основе разработаны рекомендации, результаты некоторых исследований внедрены в практику работы отдельных подразделений органов власти.

За 6 лет деятельности слушателями МАГУ разработано 84 исследовательских, социальных и управленческих проекта!
Реализовано 25 проектов, 11 проектов получили финансирование в рамках реализации целевых программ исполнительных органов государственной власти, гранты по итогам конкурсов социальных проектов Пермского края.
6 проектов, разработанных слушателями МАГУ в 2007-2012 гг. становились победителями и призерами ежегодного конкурса творческих проектов среди слушателей Малых академий государственного управления Приволжского федерального округа.